Онкологическая служба города организована в 2005 году, когда на базе онкологического отделения МУЗ ГБ № 1 и первичных онкологических кабинетов городских поликлиник был создан областной онкологический диспансер с онкологичсеким и поликлиническим отделениями.
Государственное бюджетное учреждение Ростовской области «Онкологический диспансер» в г. Волгодонске являлось специализированным лечебно-профилактическим учреждением на 65 коек, из них 40 коек круглосуточного и 25 коек дневного стационара, работающего в две смены, оказывающим специализированную онкологическую помощь жителям города Волгодонск и прилегающих 7 районов Ростовской области (Мартыновский, Волгодонской, Цимлянский, Дубовский, Заветинский, Ремонтненский, Зимовниковский).
С 2023г. произошла реорганизация в системе и все онкодиспансеры области объединили в одну организацию с филиальной сетью.
Волгодонской филиал ГБУ РО «Онкодиспансер» имеет в своей структуре стационар на 65 коек, в который входят отделение опухолей молочной железы и онкогинекологии и отделение противоопухолевой лекарственной терапии, поликлиническое отделение, Центр амбулаторной онкологической помощи (ЦАОП), а также диагностические подразделения к которым относятся клинико-диагностическая лаборатория, отделения ультразвуковой диагностики и функциональной диагностики, эндоскопическое и рентгенологическое отделения.
Учредителем и собственником имущества ГБУ РО «Онкодиспансер» является Ростовская область. Функции и полномочия учредителя ГБУ РО «Онкодиспансер» осуществляет в рамках своей компетенции, установленной норматимным правовым актом Ростовской области, министерство здравоохранения Ростовской области.